序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
本草纲目别名录
醫學三字經卷一卷二
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
叙正文跋
卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
灵药秘方
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
方症会要
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下