卷一针道源流针灸直指针灸方宜始论刺热论刺疟论刺咳论刺腰痛论奇病论刺要论刺齐论刺志论长刺节论皮部论经络论骨空论刺水热穴论调经论缪刺论经刺论巨刺论手足阴阳流注论卫气行论诊要经终论刺禁论刺法论五刺应五脏论：
史序凡例卷一风暑湿燥温热卷二咽喉耳目口齿咳嗽咳血喘胸痹虚劳不寐心悸健忘卷三肝风呕吐噎格脘痛腹痛泄泻痢疟卷四肿胀遗精遗尿淋浊疝气疮疡调经带下胎前产后
太医局诸科程文格
原序苏沈内翰良方序一苏沈内翰良方序卷第一脉说苍耳说记菊记海漆记益智花记食芋记王屋山异草记元修菜记苍术记流水止水论脏腑论君臣论汤散丸论采药论橘柚论鹿茸麋茸论鸡舌香论金罂子论地骨皮论淡竹论细辛论甘草论胡麻
小儿简要辨证节录夏禹铸望苗窍诀验虎口法初生调护脐风乳子未半岁服药法惊风辟妄一曰误搐一曰类搐暑证阴暑小儿中暑吐泻或卒然昏倒疟疾痢疾咳嗽小儿咳嗽不出声肺实咳嗽痰喘小儿痰壅喘咳小儿百嗽不止丹毒疮痈霍乱干霍乱
制药法调经论胎前论胎前诸症胎前门主方加减活法胎前方诀产后产后门主方加减（载后）产后方诀万病回生丹治产后十八症乌金散治产后十八症黑虎丹治产后血症垂死者即生
叙一叙二卷一脉法辨男女脉法调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘难产横生胎衣不下产后寒热产后血晕产后中风宿血肿胀产后腹痛半产阴户脱恶血入心恶血入脾恶血入肺恶血入肝卷二胎前恶阻胎
本草乘雅半偈自序本草乘雅义例别录〔衍〕本草乘雅凡例乘雅半偈采录诸书大意第一帙紫芝青芝赤芝黄芝白芝黑芝人参甘草黄蓍实菟丝子莲实茯苓柏实云母丹砂菖蒲赤箭薯蓣干地黄枸杞菊花麦门冬太一余粮石钟乳龙骨蜂蜜第二帙
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
原序凡例前编/分野一、〔巅顶〕二、〔头〕三、〔囟〕四、〔额〕五、〔头角〕六、〔枕骨〕七、〔颁〕八、〔HT〕九、〔面〕十、〔眉〕十一、〔目〕十二、〔目睛〕十三、〔瞳子〕十四、〔目眶〕十五、〔目内〕十六、