序卷一杂症述略卷二妇科述略胎前论治卷三产后述略
序上卷正体主治大法扑伤之症治验血脱烦躁血虚发躁气虚血热瘀血泛注瘀血作痛肝火作痛肝火忿怒肝火胁胀肝胆虚症血虚腹痛气虚不溃寒凝不溃脾虚不敛血虚筋挛肾虚气逆湿热乘肝肝经郁火痛伤胃呕药伤胃呕气血不损行气之非下
卷一序论卷二卷三卷四黄父一疽论相痈疽知是非可灸法相痈知有脓可破法卷五
序自记第一种一览延龄一卷第二种橘旁杂论上卷古今医书大意不为良相愿为良医为人子者不可不知医方技中医术为要脉四时受病原委六淫相兼说用药如用兵医不尽药石治贵人有四难医家五失七情皆听命于心再论七情总由心发人病
十剂表
自叙序卷一总论部痈疽之脉痈疽之源痈疽之别痈疽生死法察形色顺逆法内消内托法虚实症治法经络大略十二经补泻药品针砭灸烙烘照蒸拔等法针砭灸烙卷一论症治次第虚实顺逆标本论治药忌辨症论溃疡论脓血论疮口生肌验膜症变
序卷之上淫热反克之病风热不制之病七情五贼劳役饥饱之病血为邪胜凝而不行之病气为怒伤散而不聚之病血气不分混而遂结之病热积必溃之病阳衰不能抗阴之病阴弱不能配阳之病心火乘金水衰反制之病内急外弛之病奇经客邪之病
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
卷之一上草部（山草类）人参珠儿参会兰参潞党参西洋参东洋参高丽参北沙参桔梗甘草葳蕤黄精黄蓍白术苍术天麻秦艽柴胡银州柴胡前胡川独活川独活川独活川独活北细辛远志金毛狗脊淫羊霍巴戟天琐阳肉苁蓉肥白芨参三七地榆