茧唇一口疮二齿痛三舌症四喉痹诸症五喉痛六诸骨稻谷发鲠七治诸鲠咒法八误吞水蛭九诸虫入耳十蛇入七窍及虫咬伤十一男女体气十二附方并注
序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻
自叙序卷一总论部痈疽之脉痈疽之源痈疽之别痈疽生死法察形色顺逆法内消内托法虚实症治法经络大略十二经补泻药品针砭灸烙烘照蒸拔等法针砭灸烙卷一论症治次第虚实顺逆标本论治药忌辨症论溃疡论脓血论疮口生肌验膜症变
正文种痘要旨选苗蓄苗天时择吉调摄禁忌可种不可种水苗种法五脏传送之理旱苗种法痘衣种法痘浆种法信苗补种自出治法
原叙卷上咽喉说喉科总论诸风秘论阴阳论辨面色论坏症须知论证附：纂咽喉不治症喉风三十六症斗底风叉喉风咽疮风鱼鳞风双松子风单松子风帝中风双鹅风单鹅风双燕口风单燕口风重风木舌风重舌风坐舌莲花风合架风角架风爆骨
许氏医案
序一序二卷一草部上人参黄术甘草山药薏苡仁何首乌百合菟丝子淫羊藿巴戟天肉苁蓉地黄天门冬麦门冬葳蕤牛膝续断五味子沙参芍药当归紫菀知母秦艽石斛延胡索细辛小茴香远志菖蒲肉豆蔻附子补骨脂益智子木香半夏卷二草部下
六因条辨卷上春温辩论春温条辨三十条论伤暑中暑中热辨误伤暑条辨二十六条中暑条辨十一条中热条辨八条六因条辨卷中伏暑辨论伏暑条辨二十八条秋燥辨论秋燥条辨十一条冬温温毒条论冬温条辨十条温毒条辨四条六因条辨卷下
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序（一）序（二）序（三）卷一中风通关散稀涎散祛涎散紫金锭乌药顺气散八味顺气散大秦艽汤三化汤羌活愈风汤凉膈散转舌膏搜风顺气丸乌龙丹选奇汤起左汤起右汤小续命汤麻黄续命汤桂枝续命汤白虎续命汤葛根续命汤附子续